Школа была основана 15 октября 1948 года, первым директором был Гура Павел Яковлевич.
В школе культивировались следующие виды спорта: спортивная гимнастика, художественная гимнастика, легкая атлетика, бокс, шахматы, парусный спорт, волейбол, баскетбол, спортивные игры, футбол, мотоспорт.
В 1965 году в школе остались спортивная гимнастика, художественная гимнастика и легкая атлетика.
В 1967 году ДСШ №2 присвоен статус специализированной детско-юношеской школы по спортивной гимнастике, в 1975 году – специализированной детско-юношеской школы олимпийского резерва №2 города Ростова-на-Дону. Руководил школой в этот период Бекешев Герман Александрович.
В 2003 году переименована в Муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей – Специализированная детско-юношеская спортивная школа Олимпийского резерва №2 г. Ростова-на-Дону.
С 2000 года и по настоящее время директор школы – Фудимов Владимир Викторович, Заслуженный работник физической культуры Российской Федерации.
В 2001 году школа получила собственное помещение и отметила свое новое рождение, как современного спортивного комплекса со специализированным гимнастическим залом, 6 спортивными залами, восстановительным центром, комнатами отдыха, пищеблоком.
В 2011 году переименована в Муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей –Детско-юношеская спортивная школа №2 г. Ростова-на-Дону.
В 2015 году переименована в Муниципальное бюджетное учреждение дополнительного образования специализированная детско-юношеская спортивная школа Олимпийского резерва № 2 г. Ростова-на-Дону (МБУ ДО СДЮСШОР №2).
В 2017 году переименована в Муниципальное бюджетное учреждение спортивная школа Олимпийского резерва № 2 г. Ростова-на-Дону (МБУ СШОР № 2 г. Ростова-на-Дону).
В 2023 году переименована в Муниципальное бюджетное учреждение дополнительного образования спортивная школа Олимпийского резерва № 2 г. Ростова-на-Дону (МБУ ДО СШОР № 2 г. Ростова-на-Дону).
В 2007 году СДЮСШОР №2 вошла в четверку лучших спортивных школ России, по рейтингу спортивных соревнований, проводимых ФСГР.
По результатам конкурсов НБО «Фонда поддержки олимпийцев России» для специализированных детско-юношеских спортивных школ олимпийского резерва, осуществляющих подготовку кандидатов в спортивные сборные команды Российской Федерации:
- в 2010 году МБОУ ДОД ДЮСШ №2 стала лауреатом и получила грант в размере 750000 рублей;
- в 2011 году заняла 1 место и получила грант в размере 4 млн. рублей;
- в 2013 году заняла 3 место и получила грант в размере 2 млн. рублей;
- в 2015 году заняла 1 место и получила грант в размере 3 млн. рублей.
Гордостью школы являются ее знаменитые выпускники:
Гроздова Светлана – Заслуженный мастер спорта СССР по спортивной гимнастике. Чемпионка XXI Олимпийских игр 1976 года (Монреаль) в командном первенстве. Абсолютная чемпионка СССР (1976), чемпионка СССР в упражнениях на бревне (1974), серебряный призер в упражнениях на бревне (1976), бронзовый призер в вольных упражнениях.
Продунова Елена – Заслуженный мастер спорта России по спортивной гимнастике. Серебряный призер XXVII Олимпийских игр 2000 года (Сидней) в командном первенстве и в упражнениях на бревне.
Серебряный призер XXXII Чемпионата Мира 1997 года (Лозанна) в командном первенстве и в вольных упражнениях, бронзовый призер в многоборье.
Серебряный призер XXXIII Чемпионата Мира 1999 года (Тяньизынь) в командном первенстве. Чемпионка Европы 2000 года (Париж) в командном первенстве, серебряный призер в вольных упражнениях, бронзовый призер в упражнениях на брусьях. Абсолютная чемпионка России (1999, 2000), чемпионка в опорном прыжке (1997), в упражнениях на бревне (2000). Серебряный призер Чемпионатов России в опорных прыжках (1998, 2000), в упражнениях на брусьях (1999, 2000), на бревне (1997, 1999) и в вольных упражнениях (1997). Обладательница Кубка России (1999) серебряный призер в многоборье (1998, 2000), в опорном прыжке и на бревне (2000), бронзовый призер в опорном прыжке (1998).
Сафошкин Александр – Заслуженный мастер спорта по спортивной гимнастике. Участник в Олимпийских играх 2004 года (Афины), призер в упражнениях на кольцах Чемпионата Мира 2005 года, 2006 года; призер Этапа Кубка Мира в упражнениях на кольцах 2006 года, Чемпион Европы в упражнениях на кольцах 2004, 2006 г, Чемпион России в упражнениях на кольцах 2003, 2004, 2005, 2006, 2007 г.г.
Крючкова Мария – Заслуженный мастер спорта России по спортивной гимнастике. Бронзовый призер XXIII Олимпийских игр 2004 г. (г.Афины) в командном первенстве, победительница в командном первенстве Чемпионата Европы среди молодежи 2002 г. (г. Греция), победительница Открытого Кубка Америки в команде и многоборье 2001 г., Чемпионка России в вольных упражнениях 2004 г., победительница в вольных упражнениях Кубка России 2002 г. (г. Москва).
Грудко Анна – Заслуженный мастер спорта по спортивной гимнастике. Бронзовый призер в командном первенстве Чемпионата Мира 2006 года, призер Этапа Кубка Мира 2006 года, победительница в опорном прыжке Этапа Кубка Мира 2007 года, чемпионка Европы в опорном прыжке 2006 года, бронзовый призер в опорном прыжке Чемпионата Европы 2007 года, Чемпионка России в опорном прыжке 2006 года, серебряный призер в опорном прыжке Чемпионата России 2007 года, бронзовый призер в опорном прыжке Чемпионата России 2008 года, призер международного турнира им. М.Воронина 2005 года.
Нагорный Никита — Заслуженный мастер спорта по спортивной гимнастике. Трехкратный победитель и обладатель пяти медалей II юношеских Олимпийских игр 2014 (Нанкин, Китай). Серебряный призер XXXI Олимпийских игр 2016 года (Рио-де-Жанейро) в командном первенстве. Чемпион и двукратный бронзовый призер Олимпийских игр Токио 2020.
Трёхкратный чемпион мира, двукратный призёр чемпионата мира, восьмикратный чемпион Европы, трёхкратный призер чемпионата Европы, семнадцатикратный чемпион России, одиннадцатикратный победитель Кубка России, победитель спортивных игр стран БРИКС.
Награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» I степени (2016 год), орденом Дружбы (2021 год).
Уразова Владислава – Заслуженный мастер спорта по спортивной гимнастике. Чемпионка Олимпийских игр Токио 2020 в командном первенстве.
Победитель и двукратный призер чемпионата мира среди юниоров, двукратный призер чемпионата Европы, победитель и шестикратный призер чемпионата России, четырехкратный победитель Кубка России, шестикратный победитель первенства России.
Награждена орденом Дружбы (2021 год).
Ланкин Дмитрий– Заслуженный мастер спорта по спортивной гимнастике. Серебряный призер в вольных упражнениях чемпионата Европы (Клуж-Напока, Румыния) 2017 года, серебряный призер в командном первенстве чемпионата мира (Доха, Катар) 2018 года, чемпион в командном первенстве и бронзовый призер в опорном прыжке чемпионата Европы (Глазго, Великобритания) 2018 года , бронзовый призер в вольных упражнениях чемпионата Европы 2019 года, серебряный призер в опорном прыжке II европейских игр 2019 года.